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野生モンスター　108+3種

・最終段階(ストーリー全てクリア、全サブクエストクリア)で出現する場所について記載した。
・いずれのモンスターも最終段階でエンカウント可能となっており、改造モンスターの落とすアイテムについても追憶の塔で補完可能。
・レア度の高いモンスターは、レアモンスターの巣(上位モンスターはレア上位の巣)で大量に出現する場合がある。通常エンカウントの効率が良くない場合には、イノリの壺で「誕生のオフダ」を使ってレアモンスターの巣を探してみるのもあり。

オトモン　64+3+4種

・最終段階(ストーリー全てクリア、全サブクエストクリア)でタマゴを入手できる場所について記載した。
・なお、通常エンカウントによる帰巣を目指す場合の出現場所については上記“野生モンスター”を参照。帰巣発生確率を上げるには、「ペイントボール」を使い、パッシブスキル「巣守り」が付いている防具(ゴールドルナ装備、リオハート装備改、レイア装備改)を装備して、モンスターごとの帰巣条件を満たして倒す。
・レア度の高いモンスターのタマゴは、イノリの壺で「誕生のオフダ」を使ってレア上位の巣から入手するのが効率的。絆遺伝子を入手する場合も同様で、レア上位の巣でより重いタマゴを狙うとよい。
・109.「ドスプーギー」のみ、プーギー図鑑コンプリート時の1体しか入手できない点には注意。